يتولى المجلس في سبيل تحقيق اهدافه المهام والصالحيات التالية :-

• إقرار السياسة العامة للمجلس والخطط والبرامج اللازمة لتنفيذها .
• إقرار مواصفات التدريب المطلوب لكافـة الاختصاصـات الطبيـة والصـيدلانية واعتمـاد اسس تقييم هذا التدريب.
• إقرار أسس ومعايير اعتمـاد المستشـفيات والمراكـز داخـل المملكـة وخارجهـا لغايـات التدريب .
• اعتماد نتائج الأمتحانات التي تجريها اللجان المنصوص عليها في هذا القانون.
• إصدار شهادات الاختصاص للأطباء والصيادلة الذين تتـوافر فـيهم الشـروط المقـررة ويجتازون الامتحانات التي تعقدها اللجان المختصة وفقا لأحكام هذا القانون .
• الإشراف على البرامج التدريبية للأطباء والصيادلة وإجراء الامتحانات المقررة . اعتمـاد بـرامج التطـوير المهنـي المسـتمر بالتعـاون مـع المؤسسـات والهيئـات الطبيـة والصحية المختلفة.
• الموافقة على العقود والإتفاقيات التي يبرمها المجلس .
• النظر في الشـكاوى المقدمـة إليـه بالتشـاور مـع اللجـان المختصـة واتخـاذ الإجـراءات المناسبة بخصوصها.
• التنسـيق والتعـاون مـع المجـالس المماثلـة لعمـل المجلـس بمـا فيهـا المجلس العربـي للاختصاصات الصحية .
• إقـرار تنظـيم نــدوات دراســية ودورات للأطبـاء والصـيادلة الـذين يعـدون انفسـهم للاختصاص.
• تشكيل اللجان الأخرى الالزمة لمساعدته على القيـام بمهامـه علـى أن يحـدد فـي قـرار تشكيلها مهامها وواجباتها وكيفية انعقاد اجتماعاتها واتخاذ قراراتها.
• الموافقـة علـى مشـروعات التشـريعات الخاصـة بـالمجلس ورفعهـا لمجلـس الـوزراء لإقرارها حسب الأصول.
• الموافقة على مشروع الموازنة السنوية للمجلس تمهيدا لإقراره حسب الأصول.
• إقرار البيانات المالية الختامية للمجلس والتقرير السنوي عن أعماله.
• مناقشة التقارير التي تقدم اليه وفقا لأحكام هذا القانون.
• إنشاء بنك للأسئـلة بمقتضى تعليمات يصدرها لهذه الغاية والعمل على تحديثه.
• إصدار النشرات والمطبوعات التي تخدم أهداف المجلس ومهامه.
• إصدار التعليمات اللازمة لتنفيذ أحكـام هـذا القـانون والأنظمـة الصـادرة بمقتضـاه بمـا فـي ذلـك التعليمـات المتعلقـة بـإجراء الامتحانـات وإصـدار الشـهادات والتحـول الإلكتروني.
• أي أمور أخرى ذات علاقة بعمل المجلس وأهدافه يعرضها الرئيس عليه .